Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT12Q99456 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms