Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF12Q99081 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms