Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms