Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRBNQ96SW2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms