Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SIN3AQ96ST3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms