Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK5RAP2Q96SN8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms