Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPK1Q96SB4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPK1Q96SB4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms