Protein–RNA interactions for Protein: Q96QG7

MTMR9, Myotubularin-related protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR9Q96QG7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR9Q96QG7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms