Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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