Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NLRP3Q96P20 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP3Q96P20 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP3Q96P20 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms