Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM3Q96MX0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CMTM3Q96MX0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms