Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF145Q96MT1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms