Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI9

AGBL1, Cytosolic carboxypeptidase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL1Q96MI9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL1Q96MI9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
AGBL1Q96MI9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGBL1Q96MI9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms