Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
JSRP1Q96MG2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
JSRP1Q96MG2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms