Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms