Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EP400Q96L91 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms