Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDLIM2Q96JY6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms