Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCHS1Q96JQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCHS1Q96JQ0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms