Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A3Q96HJ5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms