Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCD1Q96GM5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms