Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39LQ96EH5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms