Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRRFQ96E11 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms