Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C18orf8Q96DM3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms