Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC10Q969S8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC10Q969S8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms