Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms