Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM63Q969Q1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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TRIM63Q969Q1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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TRIM63Q969Q1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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TRIM63Q969Q1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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TRIM63Q969Q1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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