Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF3C6Q969F1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C6Q969F1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms