Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCEAL3Q969E4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms