Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2A3Q93084 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms