Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED12Q93074 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED12Q93074 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED12Q93074 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED12Q93074 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MED12Q93074 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MED12Q93074 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MED12Q93074 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MED12Q93074 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
MED12Q93074 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
MED12Q93074 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED12Q93074 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED12Q93074 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED12Q93074 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED12Q93074 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED12Q93074 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED12Q93074 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED12Q93074 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED12Q93074 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED12Q93074 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED12Q93074 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED12Q93074 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED12Q93074 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED12Q93074 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED12Q93074 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED12Q93074 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED12Q93074 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED12Q93074 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED12Q93074 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED12Q93074 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED12Q93074 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED12Q93074 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED12Q93074 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED12Q93074 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED12Q93074 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED12Q93074 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MED12Q93074 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED12Q93074 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED12Q93074 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED12Q93074 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED12Q93074 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED12Q93074 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED12Q93074 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED12Q93074 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MED12Q93074 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED12Q93074 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED12Q93074 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED12Q93074 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED12Q93074 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED12Q93074 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MED12Q93074 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED12Q93074 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED12Q93074 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED12Q93074 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED12Q93074 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED12Q93074 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED12Q93074 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED12Q93074 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED12Q93074 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED12Q93074 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED12Q93074 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED12Q93074 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED12Q93074 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED12Q93074 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED12Q93074 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED12Q93074 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED12Q93074 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MED12Q93074 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED12Q93074 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED12Q93074 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED12Q93074 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED12Q93074 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED12Q93074 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED12Q93074 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED12Q93074 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED12Q93074 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED12Q93074 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED12Q93074 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED12Q93074 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED12Q93074 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED12Q93074 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
MED12Q93074 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
MED12Q93074 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms