Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXT2Q93063 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms