Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRN2Q92932 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRN2Q92932 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms