Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB1CQ92928 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB1CQ92928 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB1CQ92928 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB1CQ92928 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB1CQ92928 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB1CQ92928 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB1CQ92928 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB1CQ92928 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB1CQ92928 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB1CQ92928 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB1CQ92928 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB1CQ92928 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms