Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEO1Q92859 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEO1Q92859 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEO1Q92859 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms