Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP205Q92621 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms