Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms