Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASKIN2Q8WXE0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms