Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS9Q8WXC6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms