Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf54Q8WWF1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf54Q8WWF1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms