Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms