Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSC4DQ8WTU2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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