Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R17PQ8TDU5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms