Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf43Q8TAL5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms