Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CADM4Q8NFZ8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CADM4Q8NFZ8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CADM4Q8NFZ8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM4Q8NFZ8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms