Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER1

TRPV1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV1Q8NER1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV1Q8NER1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms