Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF548Q8NEK5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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