Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EHBP1Q8NDI1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHBP1Q8NDI1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms