Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC197Q8NCU1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms