Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COLGALT1Q8NBJ5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COLGALT1Q8NBJ5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms