Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11CQ8NB49 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms